Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Thread subject: Choix du domaine retenu

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Choix du domaine retenu
mongeoussada
26 Mar 2022 12:10
Non evaluated contribution

Bonjour,

 

Petite question avant d'être certaines de rendre la séquence, est-ce qu'un domaine "homologue superfamille" est considéré comme étant plus précis qu'un domaine ? Sachant que le domaine "homologue superfamille" rempli tous les critères pour être retenu dans la suite de l'étude, hormis le fait qu'il ne possède pas de terme GO (même si sa fonction est la même que l'autre domaine qui possède un terme GO dans InterPro).

 

Merci !

 

-Anais et Nahla

B_Wirth_22
26 Mar 2022 18:38
Game master

Bonjour, 

Il faut choisir le ou les domaines dans la section la plus précise. Dans l'ordre : domaines => Famille => superfamille. 

Donc non, superfamille n'est pas la catégorie la plus précise. 

Ce sont souvent des domaines redondants et donc de même fonction : il faut le mettre en évidence dans votre analyse. 

Bon travail, BW