Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Sujet de discussion: domaine interpro vs domaine Blast

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domaine interpro vs domaine Blast
meilu
22 Apr 2008 13:04
Contribution non évaluée
Bonjour,

Un domaine conservé avec très peu d\'information a été fourni par interpro
Lors de la reherche par Blast, un domaine conservé est détecté avec certe, peu d\'information  mais déja plus qu\'avec interpro.
Devons-nous rester sur le domaine interpro ou pouvons-nous utiliser le domaine trouvé par le blast?
Hingamp_B08
23 Apr 2008 16:03
Maître de jeu
Pas de problème, vous pouvez citer les domaines prédits lors d'un BLAST au NCBI (il s'agit alors si je me souviens bien de la banque de domaines "Conserved Domain Database" ou CDD).