Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: peu de séquences homologues

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peu de séquences homologues
luminien
22 Apr 2010 11:45
Non evaluated contribution
Bonjour,
je vous ai dit dernièrement que j'avais du mal à interpréter mes arbres (groupe d'étude = les a protéobactéries  car se sont les SEULES ayant un score supérieur au score seuil de 92.8 et je n'ai pas de groupe extérieur car aucune séquence de cette catégorie ne posséde un score supérieur au score seuil). Je ne savais pas si je pouvais dire que ma séquence appartenait donc aux a protéobactéries ou non. Ma séquence possède de plus peu d'homologues contre la banque NR. Vous me proposez d'explorer d'autres pistes mais je ne vois pas lequelles? Pourriez vous me débloquer, c'est le seul point qui m'embète pour pouvoir enfin remettre ma troisième séquence en correction 1.
Merci d'avance.
c_petitjean_10
22 Apr 2010 11:57
Game master
Bonjour,

Pouvez-vous poster ce message dans la discussion déjà entamée à ce propos svp ?
(discussion étude d'arbre je crois)
C'est simplement pour une facilité de lecture, et de suivi de vos demandes/problèmes.
Je vous réponds dès que vous avez reposté ce message.

Merci.

C. Petitjean