IMPORTANT NOTICE: service disruptions might occur during network maintenance on Monday June 1st 2026 from 13:00 to 18:00 (Paris time, also known as Central European Summer Time), we apologize for any inconveniance this may cause!

Forum "Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs"

Thread subject: alignement de séquence

[ Return to forums ]
alignement de séquence
magorne
16 Dec 2008 18:25
Contribution: Pertinent
Avec le nouveau systeme, j'arrive assez rapidement à faire les arbres a partir des alignements clustal
fait precedement ... mais lorsque je fais un alignement sous la nouvelle methode, je n'arrive pas à faire
l'arbre correspondant : j'ai toujours une erreur de reconnaissance de format ...
Je ne sais pas comment mis prendre , pouvez vous m'aider ?
Merci

Macch Magali
opale
16 Dec 2008 18:46
Contribution: Constructive
pour l'alignement il faut aller sur phylogénie.fr puis cliquer sur 'online program' puis sur clustalw. tu copies tes séquences à l'intérieur du cadre. une fois que tu as le résultat tu le mets sur l'annotathon. pour faire l'arbre tu vas sur 'phylogeny analysis' dans 'à la carte' tu décoche aligmement multiple, tu sélectionne la méthode pour ton arbre puis tu coche 'drawtree'.prends le résultat du clustalw sans oublier la phrase CLUSTAL 2.0.3 multiple sequence alignment qui est au début puis tu le mets dans le cadre. normalement çà doit marcher
Hingamp_BC08
17 Dec 2008 18:35
Game master
Je ne suis pas sûr d'avoir bien compris quel était spécifiquement le problème. Si cette question est toujours d'actualité, il faudrait préciser plus les paramètres qui mènent à l'erreur?