Bonjour, nous n'avons pas de groupe externe à étudié car nous avons que un seul genre, Comment faisons nous pour l'enraciner pour construire l'arbre phylogénétique ? Il y''a-t-il d'autres moyens ou sera t-il donc déraciné dans tout les cas ?

Bonjour,

Si il n'y a pas de possibilité de définir un groupe extérieur, alors vous devez travailler sur l'arbre non raciné. C'est à dire que vous ne pourrez pas déterminer le sens de lecture de l'arbre et donc la direction dans laquelle s'écoule le temps. Vous devrez donc faire preuve de nuance dans l'interprétation de l'arbre. Vous pourrez déterminer quelles sont les espèces dont les séquences qui se branchent proximité de la séquence étudiée, sans pour autant dire qu'il s'agit de parents proches. Par contre, vous pourrez certainement conclure que la séquence provient d'un membre de ce genre (même si vous ne pouvez pas identifier l'espèce, c'est déjà très bien).

Cordialement,

Céline Brochier