Bonjour, j'ai un problème avec mon e-value seuil, pour l'alignement je n'ai que un seul genre comme résultat donc je ne peut pas choisir de groupe externe. En changeant ma a-value seuil ce serait passible mais j'ai choisis celle-ci car dans mes 5000 résultats, c'est le seul moment ou ma e-value n'est pas continu passant de 3e-141 à 9e-132. J 'ai fait comme ça pour trouver ma e-value seuil car sinon elle est dans tout les cas supèrieure à

4e-49 (désolé fausse manip le message c'est envoyé tout seul :-(. ) et sinon la e-value est toujours continuellement décroissante avec plusieurs résultat pour une même e-value sauf à cet endroit la. Comment je fais ? J'agrandis ma e-value seuil même si ce sera pas juste du coup ? Ou je séléctionne que des résultats que avec une e-value supèrieur a ma e-value seuil donc ayant tous le même genre ?

Bonjour,

Je ne suis pas sure de comprendre parfaitement la question.

La evalue seuil indique qu'au-delà de ce seuil, les séquences identifiées dans la banque ne sont pas des homologues. Il est très peu probable que des alignements associés à une evalue de 9e-132 correspondent à des séquences non homologues.

Il faut vérifier ce point en regardant les alignements 2 à 2.

Cordialement,

Céline Brochier

J'ajouterai que si avec 5000 résultats, vous avez toujours des E-values très faibles et un query coverage élevé, cela signifie que vous avez plus de 5000 homologues. 
Vincent Lacroix