Bonsoir,

Le format NEWICK me donne un arbre dont l'enracinement observe la distinction entre mon groupe d'étude et externe. Il ya cependant 2 séquences du groupe externe qui n'ont pas l'air à leur place. Dois- je tout de même changer l'enracinement de l'arbre ?

Merci bcp et bonne soirée,

levana

Bonjour,

L’essentiel, c’est de vous focaliser sur le groupe d’étude et sur la séparation entre le groupe d’étude est externe. Donc l’arbre est bien enraciné. 
En tout cas le changement de la racine ne résoudra pas le problème des séquences mal groupées du groupe extérieur (Je suppose que vous parlez des Rhodobacterales ), mais ceci n’est pas grave.

Bon travail,
Emese Meglecz