Bonjour c'est à propos de mon ORF_EF22870.12.
En faite j'ai effectué ma recherche d'ORF et j'en ai trouvée une quinzaine.
Et j'ai effectué mon blast sur tout mes ORF. Et le problème est que je ne trouve aucun bon homologue.
En faite sur l'enssemble de mes ORF, j'ai trouvé en tout une dizaine homologues mais qui ne valent rien du tout.
C'est à dire que leurs scores sont en moyenne de 35 et leurs e-values sont d'environ 4 pouvant aller jusqu'à 9....
Maintenant je voudrais savoir ce que je dois faire? Marquer que mon ORF n'est pas codant et c'est tout ou il y a
D’autre test à faire?
PS: j'ai marqué les résultats de mes blast dans la conclusion.

Bonjour,
Les consignes de l'annothaton sont de chercher des ORF >60 codons pour éviter de
se retrouver avec de trop petits ORF.
Ensuite une fois que tu auras refait ta recherche d'ORF, la deuxième est de traiter
uniquement l'ORF le plus grand qui se trouve sur ta séquence. Mais il est quand même
possible mais pas nécessaire de faire des recherches sur les autres ORF.
A ce moment si cet ORF n'a pas d'homologue dans blast ni de domaine conservé sur
interpro, il  faut également réalisé un tblastn au  cas ou ta séquence ne code pas
pour une protéine mais  un ARNr ou t par exemple.
Si a ce moment tu n'as  aucun résultat soit ta séquence est  non codante,  
soit il s'agit d'une  nouvelle protéine ou d'un nouvel ARN totallement inconnu...
Bonne chance

Je suis un peu perplexe car la réponse est écrite noir sur blanc dans les règles du jeu et la FAQ, et cela a été répété en TD!
Votre question laisse aussi penser que vous n'avez pas du tout compris ls signification d'homologue ("une dizaine homologues mais qui ne valent rien du tout.")...
Enfin j'ai jeté un oeil sur votre fiche ORF_EF22870.12: que font des résultats bruts dans la conclusion???