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Forum "Analyse phylogénétique"
Sujet de discussion: arbre mal raciné
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arbre mal raciné
clem_va
14 Dec 2009 15:13
Contribution non évaluée
Après la 1ère correction on nous a dis que notre arbre était mal raciné et que l'on devait le raciner a partir du noeud A.
Nous ne savons absolument pas comment faire pour raciner notre arbre différemment.
pourriez vous nous éclairer s'il vous plait?
+---------------------Alphapro4_Silicibacter/Alphaproteobacteria/ref_ZP_05739023.1_gi
|
+---+ +----Alphapro11_Hyphomicrobium/Alphaproteobacteria/ref_ZP_05375339.1
| | |
| | | +-----Betaprot1_Leptothrix_cholodnii_SP-6/Betaproteobacteria/ref_YP_00
| +-----------+ |
| | | +---Alphapro3_Sagittula_stellata_E-37/Alphaproteobacteria/ref_ZP_017
| +-----+ |
| | +----+
| | | +---Alphapro8_Roseovarius_sp._HTCC2601/Alphaproteobacteria/ref_ZP_01
| +-----+
| |+--------Alphapro9_Silicibacter_pomeroyi_DSS-3/Alphaproteobacteria/ref_YP
| ++
| +------Alphapro5_Sinorhizobium_meliloti_1021/Alphaproteobacteria/ref_NP
|
| +-GOS_1107030_Traduction_18-1004_sens_indirect
| +--+
| | +--Alphapro13_Rhodobacterales/Alphaproteobacteria/ref_ZP_01447853.1
| ++
| |+--Alphapro2_Rhodobacterales_bacterium_HTCC2150/Alphaproteobacteria
| +--------------------+
| | |
| | +-Alphapro1_Rhodobacterales_bacterium_HTCC2083/Alphaproteobacteria
| |
| | +-----------------Alphapro7_Asticcacaulis/Alphaproteobacteria/ref_ZP_04770208.1_gi
| | |
+---+ +-+ +-------------------Gammapro2_Yersinia_pseudotuberculosis_IP_31758/Gammaproteobacter
| | | |
| | +--+ +--------------------Alphapro6_Bradyrhizobium_sp._BTAi1/Alphaproteobacteria/ref_YP_00
| | +----+
| | +-------------------------------------Alphapro12_Sphingomonas_wittichii_RW1/Alphaproteobacteria/ref_YP
| |
+--+ +---------------------------Gammapro1_Psychromonas_ingrahamii_37/Gammaproteobacteria/ref_YP
| |
| +---+
| | | +---------Betaprot2_Dechloromonas_aromatica_RCB/Betaproteobacteria/ref_YP
| | +-+
| | | +----Alphapro10_Magnetospirillum_gryphiswaldense_MSR-1/Alphaproteobac
+--A +---+
| +------Gammapro3_Acidithiobacillus_ferrooxidans_ATCC_23270/Gammaproteob
|
+------------Betaprot3_Methylotenera/Betaproteobacteria/ref_YP_003049202.1_gi
ETalla09
14 Dec 2009 15:45
Maître de jeu
Bonjour,
Le re-enracinement de votre arbre se fait sous phylogeny.fr, etape 6 (Tree rendering) de votre analyse phylogenetique..., puis cliquez sur le boton reroot, puis sur la branche qui servira de nouvelle racine, pour avoir le nouvel arbre...
ET