lbfm
15 May 2009 16:29
Contribution non évaluée |
Bonjour, je n'arrive pas à sélectionner mes séquences pour ensuite réaliser l'alignement multiple car
j'ai effectué un blastp contre nr avec 5000 sorties pour avoir tous les homologues, mais à chaque
fois l'ordinateur bug !
Depuis ce matin j'essaie mais en vain, alors je perds un temps fou !!!
Comment puis-je régler ce problème ?
Merci
Cordialement,
Fanny |
Brochier09
15 May 2009 16:45
Maître de jeu |
Bonjour,
Nous avons expliqué en TP que vous pouviez faire un blast en demandant 5000 réponses afin de regarder les scores, le rapport taxonomique, etc
mais que normalement vous pouvez sélectionner les séquences sur le blast avec 1000 réponses. Si ce n'est pas le cas car vous avez beaucoup de bactéries et que vous voulez voir ce qui se passe chez les archaea et les eukaryotes, vous pouvez lancer les blasts contre chaque groupe séparément. Par exemple, un blast contre les euka puis un autre blast contre les archaea, puis un sur les bacteries, etc
Cordialement,
Céline Brochier
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