Forum "Alignement multiple: CLUSTALW"

Sujet de discussion: Nombres de séquences

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Nombres de séquences
Varly
12 May 2023 0:28
Contribution non évaluée

 

Bonjour,

J'ai choisi d'étudier les Pelagibacterales en tant que groupe, mais je dispose seulement d'une dizaine de séquences, contrairement aux groupes extérieurs les non Pelagibacterales  qui comprennent de nombreuses familles 

Que puis-je faire dans cette situation ?

J'ai donc choisie pres 8 sequence du groupe des Pelagibacterales, et une trentaine pour le groupe d'exterieur, comment faire pour construire mon arbres?

 

Merci beaucoup 

Meglecz23CTES
12 May 2023 8:37
Maître de jeu

Bonjour,


Vous avez 172 séquences de Pelagibacterales, vous pouvez choisir une quinzaine. Par contre, vous pouvez diminuer le nombre des séquences de groupe extérieur. Par exemple, vous avez beaucoup de séquences de Hyphomicrobiales. Prenez une seule de chaque famille, ça sera amplement suffisant.

 

Bon travail,
Emese Meglecz