Bonjour, 

Ma question concerne la partie "Domaines protéiques". Ma protéine présente un seul domaine conservé dans le résultat d'IINTERPROScan. De plus, l'annotation de la famille est aussi complète que celle du domaine. Dans le tableau que nous devons réaliser pour résumer les résultats (en enlevant les redondances), j'ai décidé de reporter les identifiants de la famille. Mais à la fin de cette partie, vous demandez de ne conserver que 4 domaines protéiques conservés. Faut-il que je donne les informations permettant d'avoir accès à la famille ou au domaine ? 

J'espère que ma question est claire... 

Merci par avance 

Bonne soirée 

Emma Rozis

Bonsoir Emma,

Mes excuses pour le retard à te répondre, mais je ne t'ai pas oublié :)

Le tableau des "4" domaines à la fin de la rubrique "Domaines protéiques" propose 4 domaine maximum, donc si tu n'as qu'un domaine prédit, alors tu ne remplis qu'une ligne (comme ce que tu as fait pour la famille "ADH_Fe"). Ce tableau répète en général ce que vous indiquez dans le "Table 2", mais permet de dessiner un petit diagramme dans le mode "Visualisation" du panier.

Sinon tu as retenu la famille "Iron-type alcohol dehydrogenase-like", peut-être parce son E-value est très légèrement plus faible que le domaine PFAM, ceci étant le domaine PFAM est quasi aussi significatif (3 logs d'écart seulement) et sa fonction est peut-être un peu plus spécifique "Alcohol dehydrogenase, iron-type/glycerol dehydrogenase GldA" ? Ceci est juste une intuition sans rien avoir étudié dans le détail de ces prédictions.

Bon week end !