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Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: Comment choisir les homologues ?

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Comment choisir les homologues ?
nanais
11 Mar 2012 17:18
Contribution non évaluée
Bonjour,
Nous nous posions une question concernant le choix des homologues protéiques ?
Après avoir effectué un BLASTP classique contre NR avec 500 match visibles, nous nous retrouvons avec de très nombreuses séquences qui matchent. Comment choisir la plus "proche" sachant que les premières E-value sont très proches ? Faut-il recouper avec les domaines protéiques identifiés précédement (BaxI_1) ?

Merci pour vos réponses !

Team Nanais
C_Brochier_12
13 Mar 2012 14:42
Maître de jeu
Bonjour,

Je pense que le cours de ce matin à du clarifier cette question. Si ce n'est pas le cas, n'hésitez pas à me solliciter de nouveau via le forum.

Céline Brochier