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Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: Proteines hypothetiques

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Proteines hypothetiques
noapardo
2 Mar 2023 19:21
Non evaluated contribution

 

Suite a mon precedent message, j'ajoute que sur tous les ORF, aucune proteine n'a ete trouvees, toutes etant des proteines hypothetiques... qu'est ce que cela signifie ?

Merci pour votre aide,

Bien cordialement,

Meglecz23CTES
2 Mar 2023 19:25
Game master

Les protéines hypothétiques sont les séquences qui sont probablement les protéines sur base des analyses informatiques, mais on ne les a pas annotées probablement par manque d’information suffisante.
Sans indice pour la fonction, vous ne pouvez pas analyser cette séquence.

noapardo
2 Mar 2023 19:26
Non evaluated contribution

Dois je donc changer de sequence ?

Meglecz23CTES
2 Mar 2023 19:28
Game master

Si la fonction n’est pas du tout connue, alors oui.
Sans avoir des résultats bruts dans annotathon, je ne peux pas vous en dire plus.

noapardo
2 Mar 2023 19:30
Non evaluated contribution

Que veut dire des "resultats bruts" ? 

Merci pour votre aide ! 

Meglecz23CTES
2 Mar 2023 19:32
Game master

Avez-vous regardé des vidéo ?

Dans ce contexte, c'est le tableu de hit de BLAST.