Bonjour,
juste une information concernant le GO et inclus des protein domain. Pour les GO utilisez InterscanPro - indiqué dans FAQ - c'est indiqué dans les résultats avec des Protein domain en même temps. S'il n'y a pas de possibilité d'indiquer le GO que vous avez identifié, laissez le "unkonwn", mais indiqué dans les conclusions le GO trouvé.

Bon travail
Achim

Bonjour,
Lorsqu'on rentre notre séquence sur InterscanPro, comme indiqué dans la FAQ, nous obtenons :

"Raw Tool Output

We have not been able to format the results of this job (iprscan5-I20150410-130240-0128-10123036-es). This could be because the job has failed to complete.

Only the following information is available, which might contain clues as to why this has occurred.

    Tool Output : The output from the tool itself
    Tool Error Details : Error messages produced by the tool
    Input Sequence : Your input sequence as seen by the tool
    Parameters : Parameter values provided as part of the job request

For more help, please contact support, ideally quoting the URL at the top of this page."

Est-on vraiment obligé d'utiliser ce logiciel ? Les résultats obtenue avec NCBI ne sont-ils pas suffisants ?

Si je le fais, ça marche.
Allez sur: http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan5/
et soumettez votre seq proteine en fasta

Pour les annotations déjà fait NCBI est suffissant; mais c'est mieux sur InterPro... :)

Nous avons réessayé (toujours avec la séquence protéique en FASTA) et nous avons obtenu le même résultats avec plusieurs séquences différentes. :/

C'est encore plus claire sur l'autre site:
essayez sur le site:
http://www.ebi.ac.uk/interpro/search/sequence-search

Effectivement ce site fonctionne mieux, mais il faut il bien penser à retirer l'étoile qui symbolise le codon stop.
Merci :D