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Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: BlastX

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BlastX
gp1DIEUSAERT
19 May 2012 16:43
Non evaluated contribution
Bonjour,

avec ma séquence, je ne trouve rien sur le blast contre nr de même pour swissprot, j\'ai donc fais un blastx pour voir s\'il n\'y avait pas de frameshift. Je retrouve des e-value des scores de 45. Est ce que ce ceci est négligeable ou il faut que j\'en prenne compte ? Parce que les e-values et les scores sont mauvais et les séquences \"subject\" semblent avoir toutes une fonction différente.

Bien cordialement, Jonathan
R_Bourgeas_12
19 May 2012 17:53
Game master
Bonjour,

Si votre recherche Blastx ne vous donne pas de séquence homologues (c'est à vous de trouver s'il s'agit d'homologues ou non), il est bien de le dire lors de votre passage à l'oral. De toute façon, si vous avez fait une recherche, même si elle vous donne un résultat négatif, c'est toujours un résultat qui vous apprend quelque chose.

Bonne fin de journée,
Raphaël