bonjour,
on a fait un blast P pour trouver l'homologie de notre séquence. On a obtenu plusieurs séquence et le problème c'est qu'on arrive pas a les aligner ensemble et à les transformer en format FASTA.
pouvez vous nous indiquez la procédure a suivre pour l'alignement?
merci
samiahafsoi

Bonjour,

Blast vous donne des alignements locaux 2 à 2 entre votre séquence requête (query) et les séquences similaires trouvées dans la banque.
Ce sont ces alignements 2 à 2 qui vous intéressent, il n'y a pas d'autre alignement 2 à 2 à réaliser, mais un alignement multiple.

Pour sélectionner les séquences (au format FASTA) pour réaliser votre alignement multiple, cela se fait à partir des alignements 2 à 2 du blast.

Pour cela, la procédure est bien expliquée dans les "FAQ" :
Aller voir dans "Aide" -> "FAQ"

Bon travail,

Bénédicte WIRTH