Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Thread subject: Discussion de e-value

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Discussion de e-value
ameliane
1 May 2010 19:35
Non evaluated contribution
Bonjour, nous venons de recevoir la première correction de notre séquence et un des commentaires porte sur l'analyse des e-values. En effet, il nous est demandé de discuter les e-values de prédictions des domaines protéiques conservés, sauf que n'avons pas de e-value pour nos domaines, il est noté NA. Doit-on alors discuter cette absence de e-value ? Et pourriez nous indiquer que signifie NA ?

Cordiallement, Amélie
ameliane
3 May 2010 8:43
Non evaluated contribution
Bonjour, serait-il possible que NA corresponde à "Not Applicable" ce qui signifierait que nous n'avons pas de réponse concernant nos e-values et dans ce cas que faire?

Cordialement.
c_petitjean_10
3 May 2010 13:23
Game master
Bonjour,

Le "NA" doit correspondre à "Not applicable", mais dans tout les cas, cela signifie que donner un score ou une Evalue n'a pas de sens étant donné la façon dont ce domaine ou signal a été cherché.
Cela dépend de la banque utilisée en général, ou de la taille du signal trouvé.

Dans votre cas, vous n'avez pas d’Evalues associés à vos domaines mais vous n'en parlez pas. Je pense qu'on vous demande de l'expliquer, et surtout pour le domaine que vous avez choisi.
Ce n'est pas moi qui ai corrigé votre séquence, donc je vais contacter votre correcteur pour qu'il puisse vous donner une réponse plus précise.

Bonne annotation.
C. Petitjean
E_Meglecz_10
3 May 2010 14:18
Game master
Bonjour,

Généralement vous avez fait une bonne analyse, donc j'ai cherché les petits imperfections à vous signaler (et pas pour diminuer votre travail). Je voulais seulement une petit plus, car vous n'avez pas mentionné une domaine qui a une e-value (6.00). Cela ne met nullement en question de vos analyses.

Bon travail,

Emese Meglecz