Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Sujet de discussion: Obtention de 2 domaines!

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Obtention de 2 domaines!
Cachalot
14 Apr 2010 18:42
Contribution non évaluée
Bonjour,

Lorsque nous faisons InterProscan, nous obtenons une protèine dont son numéro d'accession est IPR001789. Nous observons deux domaines,un d'une e-value de 7.8e-13 et l'autre de 2.9e-24, ces deux domaines ne se chevauchent pas. Puis nous regardons son parent, IPR011006 qui possède également deux domaines, un avec une e-value de 6.5e-33 et un avec une e value de 3.8e-21 qui ne se chevauchent pas non plus. Il n'y a plus de parenté ensuite.

Nous n'arrivons à expliquer pourquoi nous obtenons deux domaines.Peut-être avons nous un seul domaine protéique mais à 2 composantes?
Merci de nous répondre.
G_Bronner
22 Apr 2010 10:17
Maître de jeu
a vrai dire, je ne comprends pas le pb. Vous avez un domaine IPR011006 présent en 2 exemplaires. qu'est ce qui vous choque?
sam