Forum "Analyse phylogénétique"

Thread subject: arbre

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arbre
farahetsalah
12 Dec 2009 22:56
Non evaluated contribution
Mr,

voila 10 jour que nous essayons tant bien que mal a réaliser notre arbre.

Nous vous avons deja adrésser 2 messages où vos explication n'ont absolument rien donné.

Notre séquence se trouve toujours éjecté de l'arbre.
Pourtant la méthodologie suivie semble bonne.

Nous avons aussi essayer de faire un arbre en mettant que notre groupe d'études et notre séquences requete:
-Notre séquences a de très bon scores avec les séquences des bactéries donc on les a choisit comme groupe d'étude les bactéries en général. Ainsi, on voit bien que notre séquence s'intègre bien avec cette famille.

Nous avons aussi réaliser un arbre qu'en mettant notre séquence requête avec notre groupe extérieur:
-Nous avons choisit comme groupe extérieur les archaebactéries puis une autre fois les eucaryotes et encore une autre fois le mélange des deux. Cependant les résultats reste les mêmes: notre séquence est éjecté de ces familles ce qui parait logique sachant que ce sont des groupes extérieurs.

Pour finir, lorsqu'on réalise notre arbre avec notre séquence + groupe extérieur + groupe d'éude: ca devient une catastrophe. La séquence requête devient toujours éjécté et ceci est valable quelque soit le groupe extérieur ou d'étude choisit.

Nous pensons conclure que notre séquence possede un groupe d'étude mais pa de groupe extérieur