ppbio
8 Dec 2009 15:00
Non evaluated contribution |
Bonjour,
Dans votre correction de notre ananlyse BLAST vous nous avez indiqué que nous pouvions déterminer le seuil de sélection véritable entre les deux groupes. Seulement les E-Values se suivent de façon linéaire et nous n'avons pas remarqué de variations particulières dans les alignements deux à deux. Comment pouvons nous donc déterminer ce seuil ?
Merci d'avance. |
CHerrmann09
8 Dec 2009 15:03
Game master |
Bonjour,
lorsque qu'il n'y a pas ce fameux saut dans les evalue, on peut se reporter au bon vieux seuil de 1e-10. C'est le seuil pour lequel on estime que les alignements ayant un evalue inférieur représente à coup sur des relations d'homologie, mais à partir duquel il faut commencer à être un peu plus suspicieux. On peut très bien avoir des homologues avecd es evalues de 1e-5, mais il faut vérifier cela sur l'alignement. Donc choisissez cela (ou quelque chose aux alentours) comme seuil. |