Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Sujet de discussion: fonction de la protéine

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fonction de la protéine
ASMA
12 Nov 2009 19:29
Contribution: Relisez les Règles du Jeu / la FAQ
Bonsoir,

on remarque que les deux domaines obtenus possède la même séquence avec quelques différences du début et de la fin  pour deux domaines différent, une qui va de 74 a 192 et l'autre de 76 a 187, est ce qu'on peut suggéré qu'on est dans le cas de la présence d'une protéine avec 2 fonctions différentes??

Bonne soirée
ETalla09
14 Nov 2009 23:30
Maître de jeu
Bonjour,

Les deux domaines que vous mentionnez representent une seule region sur votre proteine. Si vous regardez les fiches de banque de chaque domaine, vous remarquez q'un des domaines (SSF....) a une description structurale du domaine, et elle meme fait partie de la grande famille des peptidase M23 (qui est le second domaine) "This structural motif is also found in peptidoglycan hydrolase LytM, a member of peptidase family M23, although it contains an extra N-terminal, non-conserved beta-sheet subdomain." En somme, vous n'avez qu'un seul domain, choisissez de preference le second "Peptidase M23" car la descriprion fonctionnelle est plus large ...

Bon courage,

ET