Forum "Recherche d'ORF"

Thread subject: codon STOP

[ Return to forums ]
codon STOP
NAME
10 Nov 2009 17:36
Contribution: A little confusing
Bonjour,

Lors de la correction vous nous avez écrit que: " ORF/Analyse: Un ORF "any codon" débutant à plus de 3pb de l'extrémité ne peut pas être incomplet en 5' (car codon stop en amont)!"

Nous considérons donc notre methionine en position 24 comme notre START ( car il n'y en a pas d'autre et qu'aucun BLAST ne nous permettrait de suggérer une methionine en amont)et donc notre ORF commencerait bien à plus de 3 pb de l'extrêmité.
Nous avons ensuite voulu identifier un STOP en 5' de la séquence mais nousn'avons pas trouvé de codon TAA, TAG ou TGA. S'agit il d'une erreur de notre par ou existe t'il d'autre moyen de déterminer ce STOP?

Merci
ETalla09
14 Nov 2009 23:32
Game master
Bonjour,

Reponse donnee en TD...

ET