Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Sujet de discussion: swissprot

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swissprot
anacora
12 May 2009 14:58
Contribution non évaluée
Bonjour,
Lors d'un blastp dans la banque swissprot, nous avons obtenus des moins bonne e-value que dans nr, nous avons donc dit que notre protéine ne se trouvé pas dans swissprot (qui est une banque avec moins de séquences mais plus d'information).
Cependant dans la correction, vous nous avez dit que ce n'était pas la seul possibilité mais nous ne voyons pas ce que cela peut-être????
Notre séquence est GOS_807020

Merci d'avance, Anais Landais et Coralie Beucher
Brochier09
12 May 2009 16:35
Maître de jeu
Bonjour,

"Lors d'un blastp dans la banque swissprot, nous avons obtenus des moins bonne e-value que dans nr, nous avons donc dit que notre protéine ne se trouvé pas dans swissprot" << que voulez vous dire exactement? Lorsque vous dites que "votre protéine" n'est pas dans la banque swissprot? Quelle question posez vous lorsque vous faites des recherches dans les banques?

Cordialement,

Céline Brochier