Forum "Analyse phylogénétique"

Thread subject: bootstrap

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bootstrap
louss_riquet
9 May 2009 19:47
Non evaluated contribution
bonjour,
J'ai une analyse par bootstrap et j'obtiens :
. Sequence file : phyml8drN2A1i/input.phy
. Data set : #1
. Tree search : NNIs. Initial tree : BIONJ
. Model of amino acids substitution : WAG
. Number of taxa : 19
. Log-likelihood : -4171.31251
. Discrete gamma model : Yes
  - Number of categories : 4
  - Gamma shape parameter : 1.340
. Proportion of invariant : 0.132
. Time used 0h52m52s
. -> 3172 seconds
mais je ne sais absolument pas comment analyser ou interpeter ces resultats.
Pourriez m'aider ou me donner quelques indications s'il vous plait?

merci
Brochier09
13 May 2009 11:08
Game master
Bonjour,

Les informations que vous avez copier/coller sont a priori les informations de l'analyse. Il ne s'agit pas du tout de l'arbre.
Il faut que vous essayez de récupérer ce dernier.

Cordialement,

Céline Brochier