Forum "Analyse phylogénétique"

Thread subject: problème d'arbre

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problème d'arbre
vleonet1
24 Mar 2007 20:57
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bonsoir!
Nous espérons que cette fois, nous sommes au bon endroit!
Nous avons toujours le même problème en ce qui concerne l'arbre. Notre Orf se trouve dans notre groupe extérieur.
Nous espérons que cette fois; il sera lisible pour vous.
Si nous ne réusssisons pas à nous en sortir avec cette séquence, est il possible de présenter notre séquence n°1?
Merci.
Vanessa et Angisitraka.
Brochier_B07
25 Mar 2007 11:37
Game master
Bonjour,
Il faut impérativement que vous appreniez à formuler vos demandes si vous désirez de l’aide ! Pensez aux personnes à qui vous demandez de l’aide et des conseils. Essayez de leur faciliter la tache.
En particulier en expliquant au minimum quel a été votre raisonnement pendant votre analyse :
-        Quel est votre groupe d’étude
-        Quel est votre groupe extérieur
-        Comment avez-vous choisi vos séquences
-        Que pensez-vous de la qualité de l’alignement multiple ?
Autre remarque : les noms des séquences ne sont pas formatés au niveau de l’alignement multiple donc il est impossible de faire le lien avec l’arbre. Je vous rappelle que cette opération doit se faire avant de réaliser l’alignement multiple.
J’ai l’impression que certaines des séquences de l’alignement multiple ne sont pas homologues et/ou que vous avez mal défini votre groupe extérieur.
Donnez moi plus de détails pour vous que je puisse vous aider plus.
Cordialement,
Céline Brochier
PS Il est hors de question que vous présentiez un autre lot que celui-ci à l’oral.
vleonet1
25 Mar 2007 21:36
Non evaluated contribution
Nous avons faits des petites modifications dans l'espoir d'être plus clair..
j'espère que ce sera plus facile à voir.