Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: A quoi correspondent les hits?

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A quoi correspondent les hits?
anacora
31 Mar 2009 19:32
Non evaluated contribution
Quand on fait un blastp à quoi corresponds le nombre de hits? et comment savoir quel hit est un homologue et quel hit ne l'est pas?
Merci d'avance.
Brochier09
31 Mar 2009 19:40
Game master
Bonsoir,

Les hits correspondent à des alignements locaux jugés significatifs au vu des paramètres/critères utilisés pour faire le blast.
Quant à savoir si ils correspondent à des homologues où non, il vous faut regarder les alignements 2 à 2 pour évaluer si ils s'agit d'homologues ou non. La je vous renvoie à ce qui a été fait en TD/TP.

Petite remarque en passant, veillez à signer vos mails avec vos noms d'étudiants.

Cordialement,

Céline Brochier