Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: mélange de groupe dans l'arbre

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mélange de groupe dans l'arbre
LEVY
10 Mar 2023 0:35
Contribution non évaluée

Bonjour,

Jai changé de séquence à analyser et j'obtiens les mêmes groupes que précédemment ( Flavobacteria pour le groupe d'étude) mais quand je fais l'arbre il est encore une fois mélangé...

Dois je abandonner cette séquence ?

 

Cordialement

 

Meglecz23CTES
10 Mar 2023 9:09
Maître de jeu

Bonjour,

 

En effet, les deux situations sont similaires. De plus, cette séquence a une fonction moins précise.


Pour le moment, la troisième piste de mon message précédent (http://annotathon.org/?seeThread=3523 ) semble la meilleure option. Si vous analysez la séquence OMRGCv2_10997060 avec beaucoup de précaution et avec une recherche biblio supplémentaire, cela peut rattraper le problème de l’incertitude taxonomique. Mais cette un exercice plus difficile, car ça sort de cadre défini.


Courage,
Emese Meglecz

 

LEVY
10 Mar 2023 11:11
Contribution non évaluée

D'accord merci beaucoup pour vos réponses

Bonne journée