Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: autres ORF possibles sur blast x

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autres ORF possibles sur blast x
Anissa
13 Apr 2022 13:17
Non evaluated contribution

Bonjour,

 

j'ai réalisé le blastX pour vérifier si je pouvais étudier l'ORF2 qui correspond à chaque condition d'étude de départ.

En regardant le résultat du blastX, identité à 78% et longueur d'alignement à 328, je voudrais poursuivre l'étude sur cet ORF.

Je me demande seulement si je peux continuer étant donné qu'il y a possibilité d'avoir d'autres ORF ou s'il est plus judicieux de prendre une autre séquence.

 

merci pour votre réponse,

cordialement

 

 

 

 

Meglecz21CTES
15 Apr 2022 18:35
Game master

Bonjour Anissa,


Probablement vous devez faire les analyses avec plusieurs séquences avant de choisir la séquence que vous allez soumettre.
A priori, cette séquence est bonne, avant que vous arriviez à la phylogénie, rien n’est sûr.

 

Emese Meglecz