Forum "Alignement multiple: CLUSTALW"

Sujet de discussion: Nombre de gap internes

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Nombre de gap internes
soleneA
13 Apr 2022 11:32
Contribution non évaluée

Bonjour, 

 

Sur quelle sequence devons-nous nous baser dans l'alignement multiple pour compter le nombre de gaps internes ? 

Je me positionnerais sur l'ORF mais je prefererais verifier avec vous. 

 

Solene Assie 

Meglecz21CTES
15 Apr 2022 18:44
Maître de jeu

Bonjour Solène,

 

Il suffit à donner le nombre approximatif des positions de l’alignement qui ont des gaps. Quand je parle de la position de l’alignent, je fais référence à des colonnes de l’alignement. Par exemple à la première position de votre alignement, il y a un C dans l’ORF, et un gap externe dans toutes les autres séquences.

 

Emese Meglecz