Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Sujet de discussion: Base de données

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Base de données
ilonaMi
20 Sep 2021 11:15
Contribution non évaluée

Bonjour Monsieur, 

 

J'ai une question concernant le tableau du formulaire "Domaines conservés" de l'Annotathon où l'on doit renseigner un ou plusieurs domaines qui nous semblent pertinents. Mon numéro d'accession est valable pour la base de données "PANTHER", mais celle-ci n'apparait pas dans les 4 choix possibles. Est-ce normal? 

Je vous remercie par avance pour votre réponse. 

 

Bonne journée, 

Ilona 

P_Hingamp_MM21
20 Sep 2021 12:03
Maître de jeu

Bonjour,

En effet toutes les banques de données membres de la fédération INTERPRO ne sont pas listées dans ce petit menu déroulant. Si ta prédiction PANTHER est intégrée dans INTERPRO, alors tu peux citer l'identifiant INTERPRO. S'il ne l'est pas ("unintegrated", ce qu in'est pas ton cas) tu pourrais sélectionner malgré tout INTERPRO dans le petit menu déroulant, puis utiliser l'identifiant dans la banque PANTHER (ici "PTHR32552").

Bonne journée !
Pascal H.