Forum "Analyse phylogénétique"

Thread subject: pas d'arbre possible

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pas d'arbre possible
MarieLoane
2 May 2021 16:49
Non evaluated contribution

Bonjour,

On a fait un alignement multiple avec mon binome qui nous semble bon selon nos indications. Seulement lorsqu'on lance la construction de l'arbre phylogeny.fr nous affiche un message d'erreur. Nous n'avons donc aucun arbre....

Alan_BEN
2 May 2021 19:03
Non evaluated contribution

Bonjour, même problème... J'essaye depuis 12h, j'ai changé les alignements des centaines de fois et rien ne fonctionne sur PhyML. Le site Phylogeny.fr s'arrête aussi de fonctionner pendant des intervalles de temps aléatoires.

B_Wirth_21
2 May 2021 22:23
Game master

Bonsoir,

 

si PhyML ne fonctionne pas sur Phylogeny.fr, il faut utiliser le site mirroir (même site localisé sur un serveur à Montpellier) : cela avait été mentionné.

(Par contre, BioNJ fonctionne sans problème sur phylogeny.fr, MAIS ne focntionne pas sur le site mirroir).

 

Sur la page d'accueil de Phylogeny.fr, dans l'encadré gris, en bas, cliquez sur "Mirror Site".

C'est le même site, même présentation, seule différence, vous ne pouvez pas récupérer le format texte de l'arbre, uniquement format pdf ou png, il vous faudra insérer une image (voir message posté correspondant) ou refaire l'enracinement avec l'outil local à partir du format Newick.

 

Vous terminerez demain, j'accorderai un délai supplémentaire.

 

Bon travail,

BW