Forum "Alignement multiple: CLUSTALW"

Sujet de discussion: alignement

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alignement
lea19
14 Apr 2021 22:56
Contribution non évaluée

bonsoir 

j'ai deux questions : 

- est ce que pour le report taxa c'est un probleme de selectionner ceux avec un bon e valeur mais une fonction hypotétique 

- est ce que vous pouvez si mon alignement cruswal est bon ? j'ai plus de 100 positions restantes mais sur 554 ce qui me fait environ 21 %.

 

merci de votre réponse

Meglecz20CTES
15 Apr 2021 18:29
Maître de jeu

Bonjour Léa,


- est ce que pour le report taxa c'est un probleme de selectionner ceux avec un bon e valeur mais une fonction hypotétique

 

Non, c’est bon pour la phylogénie.


- est ce que vous pouvez si mon alignement cruswal est bon ? j'ai plus de 100 positions restantes mais sur 554 ce qui me fait environ 21 %.


Oui, l’alignement est bon. Le faible pourcentage des positions retenues par Gblocks et dû au fait que l’ORF est incomplet.


Bon travail,
Emese Meglecz

 

lea19
15 Apr 2021 20:20
Contribution non évaluée

Ok merci beaucoup