Forum "Recherche d'ORF"

Thread subject: ORF Finder results

[ Return to forums ]
ORF Finder results
Fatima
5 Mar 2021 11:23
Non evaluated contribution

Bonjour,

après avoir suivi toutes les étapes décrite sur la vidéo d'explication j'ai trouvé ces résultats si dessous, est ce que c'est une erreur de ma part ou je dois changer le lieu d'échantillonnage ? Merci 

Meglecz20CTES
5 Mar 2021 13:18
Game master

Bonjour,


Il est possible que certaines séquences ne contiennent aucune ORF.
En effet, vous n’avez pas d’ORF sur le brin direct de votre séquence. N’oubliez pas à tester le brin reverse.

 

Cordialement,
Emese Meglecz

aminaza
18 Mar 2021 8:51
Non evaluated contribution

bonjour , j'ai deux questions :

1. Dans le cas ou il y aura des OFR dans la séquence réverse est ce qu'on peut garder la séquence malgré l'absence de OFR dans la séquence directe  , 

2. Quand j'ai cherché les OFR dans ma séquence directe il y avait aussi les OFR de la séquence réverse , est ce que c'est normal ??

Merci d'avance , cordialement 

Meglecz20CTES
19 Mar 2021 12:52
Game master

Bonjour,

 

1. Dans le cas ou il y aura des OFR dans la séquence réverse est ce qu'on peut garder la séquence malgré l'absence de OFR dans la séquence directe  ,


Oui


2. Quand j'ai cherché les OFR dans ma séquence directe il y avait aussi les OFR de la séquence réverse , est ce que c'est normal ??


Oui, mais s’il y a un chevauchement entre des ORFs, alors ou moins un de deux est un faux positif. Cela ne vous empêche pas à travailler avec l’ORF codant.