Forum "Recherche d'ORF"

Sujet de discussion: Question

[ Retour aux forums ]
Question
NoelGrafenstein
4 Nov 2020 19:09
Contribution non évaluée

Bonjour Monsieur,

si jamais tout les orfs qui valent la pleine de passer par blastX ont des réssultat à 99% ou 100% d'indentique pour des proteines connues et annotées, cela veut dire qu'on pendre en panier une autre sequence ?

 

Autre questions, Comment fait t'on pour connaitre le nombre d'allignements blast pour le tableau ? Car en blastant ça nous affiche au maximun 100.

Merci d'advance pour les réponses

dgautheret1
4 Nov 2020 20:28
Contribution non évaluée

Q1: Oui. 99% ID -> prendre une autre séaunce. 

Q2: avant de lancer Blast, il faut aller dans les paramètres avancés et choisir max alignment = 10,000 ou 20,000

Cordialement,

DG