Forum "Analyse phylogénétique"

Thread subject: arbre

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arbre
BNPA
17 Apr 2008 9:05
Non evaluated contribution
bonjour dans la correction 1 de notre ORF le correcteur nous marque ceci:
-\"il est proche des flavobacteria autrement dit des bactérie du groupe CFB,
mais également notre ORF est proche de séquences appartenant à des Fusobactérie.
Cette dernière précision nous empeche d\'affiner la prédiction sur l\'espéce\"
-> et pourquoi pas enrichir votre arbre d\'autres CFB?
Tant qu\'à faire éliminez les fausses séquences du groupe ext qui semblent semer un peu la zizanie
dans votre aln multiple?

quand on rajoute des CFB et que l\'on elimine les 4 grp ext qui sont des plantaes et qui ne sont pas
rééllement ext, notre alignement multiple est amélioré et notre query sort avec des alpha protéobactéries
et non plus entre les CFB et les Fusobacterie. Que faire?????
Hingamp_B08
22 Apr 2008 11:27
Game master
Je ne comprends pas bien car vos nouveaux arbres ne semblent pas racinés sur le groupe ext, et votre query ne semble pas 'sortir' avec les alpha protéobactéries?