bonjour!
nous n arrivons pas à en raciner notre arbre malgré différents tentative de recherche de groupe extérieur.
en effet nous avons des E-value très élevées avec des scores aussi considérable. cependant nous avons augmenté
le nombre de Hits à 1000 et les séquences "non homologues" choisie ne nous donnent pas un arbre raciné.
Nous ne savons pas comment expliquer ce fait. Pourriez vous nous dire comment devons nous procéder pour en raciner notre arbre?
Notre ORF est: ORF_NP24130.34

Bonjour,

Je ne comprends pas bien votre problème.

Quand vous postez un message sur le forum essayez de donner un maximum de renseignements pour qu'on puisse vous répondre de manière correcte.

"nous n arrivons pas à en raciner notre arbre malgré différents tentative de recherche de groupe extérieur" << Quelles tentatives? donnez des détails.

Je vous rappelle que la définition d'un groupe extérieur se fait par rapport au groupe d'étude choisi. Quel groupe d'étude avez choisi dans votre cas ?

Je vous rappelle également, que les séquences choisies pour constituer le groupe extérieur doivent être homologues ! donc je ne comprends pas cette phrase "et les séquences "non homologues" choisie"

Enfin, ce que vous avez copier/coller dans la case rapport taxonomique n'est pas correct.

Cordialement,

Céline Brochier