Bonjour,

Nous avons reçu la correction de notre ORF_YH24160.55 mais il y a quelques points que l'on ne comprend pas.

"Vous auriez pu choisir plus de séquences" ? Nous avions bien choisi 15 séquences pour le groupe d'étude. Doit-on en mettre plus ?

"vous n'avez pas tout collé pour le blast contre swissprot" Lors de notre première conclusion, nous l'avions collé et Mr Hingamp, le correcteur, nous avait dit que nous devions l'enlever ! Au final que doit-on faire ?

" (dans notre conclusion) "En étudiant un plus grand nombre de séquence lors du blastp, il serait peut-être possible de déterminer ce seuil. Toutefois le logiciel utilisé ne nous permet pas cette manipulation." => (correction) vous avez fait (d'après ce que vous avez dit) un blast en demandant 1000 hits, blast vous permet d'aller jusqu'à 20000"
Avec le logiciel Blast, on ne peut pas aller au-delà de 1000 hits car après on n'obtient plus rien ! c'est ce que nous avons voulu expliquer. Pourquoi nous avoir dit d'en faire jusqu'à 2000 ?

"On constate que toutes les séquences homologues à notre ORF débutent bien avant celui-ci, on peut donc supposer qu'il existe un codon stop, sans fonction biologique qui nous empêche d'estimer le point de départ de notre ORF.
Notre séquence commençant au 2è acide aminé, on ne peut prédire la position du codon start de notre ORF car le début de notre séquence se situe dans un fragment nucléique dont on ne dispose pas. Réaliser un Blastx serait donc ici inutile."

De plus, je ne comprend pas comment trouver la proportion d'aa manquants à l'extrémité 5' de notre ORF. En effet, l'explication donnée dans notre conclusion nous avait été expliquée par Mme Brochier.

Merci d'avance pour votre réponse.