Bonjour, 

Dans la partie de l'alignement multiple : 

3. Analyse de l'alignement multiple / informations sur la reconstruction phylogénétique

On voudrait savoir quel est le rapport entre le nombre de positions conservées et l'arbre phylogénétique attendu?

 Aussi, vous demander si ce nombre est suffisant pour être exploité or on a pas une référence pour comparer ? Alors comment savoir si c'est suffisant ou non ? Et que voulez-vous dire par " comment sera l'arbre" ? 

Merci. 

Bonjour,

Si le nb de positions retenues, positions convenablement alignées, est suffisant, on peut estimer que l'arbre phylogénétique reconstruit sera fiable.

Il faut au moins 100 positions retenues.

En dessous, si vous avez des incohérences dans vos arbres, on peut également mettre en cause le faible nb de positions utilisées pour la reconstruction phylogénétique.

Bon Travail,

BW