Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Sujet de discussion: Infos à mettre dans le Tableau

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Infos à mettre dans le Tableau
GRA1_Antoine
9 Feb 2019 21:11
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Salut,

J’ai une petite question concernant le remplissage du tableau pour la partie protéique. Pour ceux qui ne savent pas de quoi je parle, il s’agit du tableau 2 de la règle du jeu (Table 2: List of conserved protein domains identified by  InterproScan).

Ma question est : Faut-il renseigner dans ce tableau les résultats d’InterPro concernant les Homologous superfamily, Family, Domains et Site ? Ou faut-il uniquement se concentrer sur les Domains ?

ScreenShot d’illustration :

https://zupimages.net/up/19/06/66s0.png

Merci d’avanche et Bon Dimanche

 

GR1_CALLOUD
9 Feb 2019 23:14
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Salut,

Faut uniquement donner le ou les domaines que t'as si ils sont dans la banque interpro y'a un petit D a coté de leur numero de reference interpro et faut aussi que tu verifies ceux en gris. Mais dans tout les cas faut que des domaines

GRA1_Antoine
9 Feb 2019 23:20
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@GR1_CALLOUD :

Merci pour ta réponse ;)

> et faut aussi que tu verifies ceux en gris

Bin… la prof n’avait pas dit qu’il fallait regarder les gris que si on n’avait aucun domaine trouvé ? Puique justement les gris sont les domaines pas encore intérégrés dans InterPro… Donc qu’il ne fallait pas en tenir compte si on avait des résultats de domaines…

GR1_CALLOUD
9 Feb 2019 23:42
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 il m'avait semblé qu'elle avait dit qu'on pouvait regarder , mais j'ai peut etre mal compris ! fin bon si elle a dit le contraire te casse pas la tete alors ^^

GrA1-LiS
10 Feb 2019 11:45
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Heuh, dans mon groupe la prof a dit de mettre dans le tableau tous les résultats d'interpro sauf ceux en gris

GRA1_Antoine
10 Feb 2019 14:38
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@GrA1-LiS :

On est d’accord…

Sauf que ; j’ai demandé à une M1 de bio-info et elle me confirme qu’il ne faut mettre que les domaines en verts dans le tableau… Et cela va bien en accord avec la règle du jeu…

Donc heureusement qu’il y a une première correction avant les corrections finales de mars. De cette façon on saura ce qu’il faut bien mettre dans le tableau.

Merci pour vos réponses ;)