Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Sujet de discussion: Pas de GO-terms

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Pas de GO-terms
Rosonp
27 Apr 2018 16:50
Contribution non évaluée

Bonjour, 


Il y a effectivement des sorties avec INTERPRO mais rien au niveau des GO-terms.. je ne vois donc pas comment faire?

Cordialement, 

Rosalie PRAT

B_Wirth_18
29 Apr 2018 16:25
Maître de jeu

Bonjour,

regardez la ou les différentes fiches Interpro.

Si vous n'avez aucun terme GO renseigné dans Interpro, il faut aussi regarder les fiches Swissprot : les fiches des homologues obtenus lors du blast vs SP.

Ces termes GO (identifiés dans interpro et/ou SP) doivent vous aider à choisir un terme GO dans chacun des menus déroulants.

Si vous n'avez aucun terme GO renseigné ni dans Interpro, ni dans SP, vous pouvez soit choisir un terme se rapportant à la fonction que vous avez identifiée, soit choisir "unknown" dans le menu déroulant correspondant.

Bon travail,

BW