Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: Chevauchements

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Chevauchements
IrigarayA
28 Apr 2015 18:22
Non evaluated contribution
Bonjour Madame,

Dans mon annotation de séquence, je dois parler des chevauchements entre les groupes du rapport taxonomique.
Mais dans mon cas, dois-je juste dire que tous les groupes se chevauchent et ce que cela implique ?

Je vous remercie d'avance pour votre réponse.

Cordialement,

Anaïs
B_Wirth15
30 Apr 2015 14:53
Game master
Bonjour,

Oui, il faut décrire les chevauchements entre les groupes du rapport taxonomique, en chiffrant pour être précis.
Attention, tous les groupes vont se chevaucher plus ou moins.
Ce qu'il faut regarder, c'est :
- est-ce que TOUS les groupes se chevauchent de manière importante => dans un tel cas, vous ne pouvez pas vous focaliser sur un groupe en particulier, et votre groupe d'étude sera alors très large;
- ou est-ce qu'un groupe présente des evalues bien plus faibles que les autres groupes, dans ce cas, vous pouvez vous focaliser sur ce groupe taxonomique, voire un sous-groupe taxonomique particulier;
- ou est-ce que qq groupes taxo présentent des evalues bien plus faibles que les autres groupes, auquel cas, il faut donc élargir le groupe d'étude pour inclure ces qq groupes
==> vous seriez ds ce 3eme cas... c'est donc à justifier.

Bon travail,
BW