Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Thread subject: aa size

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aa size
M_LIinot
22 Apr 2015 12:54
Non evaluated contribution
Bonjour,
je rencontre un problème qui est le suivant, quand on change la place de la méthionine après un alignement multiple, cela change la taille en aa de la protéine et du coup les intervales des domaines conservés ne correspondent plus car par exemple dans le cas présent, après modification de la place de ma méthionine, je me retrouve avec 307aa et en lors des conserved domains il m'indique un interval 9-309 (ce qui dépasse) du coup que fait t'on ?
merci de vos réponses,

cordialemnt,
Matthieu
A_Quaiser
29 Apr 2015 10:56
Game master
Ce n'est pas un problème, indiquez que vous avez changé l'ORF basé sur l'alignement, aussi dans les conclusions.

Je n'avez pas vu ce message avant..

Cordialement
Achim