Forum "Analyse phylogénétique"

Sujet de discussion: Etiquettes arbre

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Etiquettes arbre
IrigarayA
29 Mar 2015 11:22
Contribution non évaluée
Bonjour,

Pouvez vous s'il vous plait nous rappeler ce qu'il faut noter sur chaque étiquette de l'arbre ?
Il me semble qu'il faut noter le nom complet du groupe taxonomique auquel la séquence appartient mais il me semblait que d'autres informations devaient être ajoutées.

Je vous remercie d'avance.
Bon dimanche

Anaïs
B_Wirth15
29 Mar 2015 15:58
Maître de jeu
Bonjour,

Dans la plupart des cas, vous n'avez pas besoin de rajouter quoique ce soit.
Le groupe taxonomique étant déjà inclus dans la dénomination de la séquence.
Vous devez ajouter un nom de groupe sur l'arbre, entre [xxxxx], si les noms de groupe ou de sous-groupe n'apparaissent pas dans la dénomination de la séq.
Par exemple, votre groupe d'étude est l'ensemble des cyanobactéries, mais au sein de ce groupe vous avez plusieurs sous-groupes que vous avez représentés. Si le nom de sous-groupe n'apparaît pas dans la dénomination de la séq, ajoutez le entre [] sur votre arbre au format texte que vous mettez dans les resultats bruts.

Bon dimanche,
BW