Forum "Analyse phylogénétique"

Thread subject: Arbre noeuds profonds mal soutenus

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Arbre noeuds profonds mal soutenus
Ali_Attaf
9 Dec 2014 16:30
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Bonjour,

Nous avons un soucis avec notre arbre. Suite à la correction de notre séquence, nous avons du enlever certaines séquences de notre alignement multiple (des delta protéobactéeries qui semblaient avoir un comportement différent) ce qui a entrainé un problème au niveau de l'arbre : les noeuds profonds sont mal soutenus ... Nous avons donc tenté de refaire l'alignement avec une curation moins stringente, le résultat est le même ... Que faire ?

Voici le lien vers notre arbre enraciné et avec une curation moins stringente http://phylogeny.lirmm.fr/phylo_cgi/alacarte.cgi?workflow_id=b958ef0c242add55667819822cac2c86&tab_index=5.2

Merci pour votre aide.
Ali_Attaf
11 Dec 2014 10:04
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Nous avons finalement eu la réponse à notre question en TD. Merci.