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Forum "Domaines conservés: INTERPRO"

Thread subject: Incompréhension d'une remarque

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Incompréhension d'une remarque
LB-MN
21 Nov 2014 14:02
Contribution: Pertinent
Bonjour,

Nous procédons à la deuxième annotation de notre première séquence et nous n'avons pas compris une remarque faite sur notre tableau synthétique des domaines conservés qui est la suivante :
"Domaines Protéiques/Résultats: L'intitulé de la banque d'origine doit être le numéro d'accession du domaine que s'il n'y a pas d'intitulé fonctionnel".
Que devons nous mettre exactement dans la colonne "intitulé de la banque d'origine (premier sur la ligne)" et quel est le lien avec un intitulé fonctionnel ?

Nous vous remercions de vos réponses,

LB-MN
P_Hingamp14
21 Nov 2014 14:08
Game master
Bonjour,

Par exemple pour votre domaine N°5, "Intitulé banque d'origine" = "Pyruvate carboxyltransferase domain" et non "PS50991" alors que l' "Intitulé Interpro" = "Pyruvate carboxyltransferase":

Translation        ac121451a78b1e12d416b7cd4ba06661        330        ProSiteProfiles        PS50991        Pyruvate carboxyltransferase domain.        1        158        24.504        T        25-09-2014        IPR000891        Pyruvate carboxyltransferase        GO:0003824