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Forum "Alignement multiple: CLUSTALW"

Thread subject: Alignement multiple avec GBlocks

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Alignement multiple avec GBlocks
SoulaNin
31 Oct 2014 15:28
Contribution: Pertinent
Bonjour,

Nous avons un problème avec l'outil Gblocks. Notre alignement ne peut pas se faire, que ce soit avec l'alignement multiple au format FASTA issu de MUSCLE, ou avec nos séquences au format FASTA.
Le site nous indique ce message :

"Gblocks did not work

Please check that the file format is correct
Generated by Gblocks Server".

Après la panne du plan B (site miroir de phylogeny), et notre incompréhension face au plan C (outils individuels), y aurait-il un plan D pour faire nos alignements multiples ?
P_Hingamp14
3 Nov 2014 18:10
Game master
Le plan B (http://phylogeny.lirmm.fr/phylo_cgi/alacarte.cgi) semble parfaitement fonctionnel, que ce soit en workflow complet:
http://phylogeny.lirmm.fr/phylo_cgi/alacarte.cgi?workflow_id=aac681b65c7ce571319ed1894e4f707e&tab_index=6&go_next=1

ou en choisissant GBLOCKS seul (format CLUSTAL en entrée):
http://phylogeny.lirmm.fr/phylo_cgi/one_task.cgi?task_type=gblocks&workflow_id=aac681b65c7ce57108d22e079d1d2c5a&tab_index=3

Peut-être y-a-t-il eu une panne ponctuelle du plan B (Phylogeny.fr au LIRMM)?