Forum "Alignement multiple: CLUSTALW"

Sujet de discussion: error alignement multiple

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error alignement multiple
Bonaiti
21 May 2012 16:14
Contribution non évaluée
Bonjour,

lorsque je rentre toutes mes séquences pour faire l'alignement multiple avec t-coffee, un message d'erreur apparait : Alignment input: sequences too long (in average). Et je ne vois pas bien ce que je peux faire pour y remedier. Qu'est ce que je dois faire?  

Merci
R_Bourgeas_12
21 May 2012 19:42
Maître de jeu
Bonsoir,

En fait, vous ne pouvez rien faire ; T-coffee est un programme d'alignement multiple très coûteux en temps de calcul, donc il n'accepte pas les séquences trop longues, ce qui est votre cas.
Je vous conseille donc d'utiliser les autres programmes d'alignements multiple.

Bonne soirée,

Raphaël
Bonaiti
21 May 2012 20:48
Contribution non évaluée
Bonsoir,

J'ai aussi essayé avec ClustalW et Muscle mais j'obtiens le même résultat. Je ne peux donc pas faire l'alignement multiple?

Merci. Bonne soirée