IMPORTANT NOTICE: electrical maintenance in the Annotathon server room on Monday December 11th 2017 from 18:00 to 22:00 (Paris time, also known as Central European Summer Time GMT+1H) means no annotation will be possible during this downtime!

Forum "Alignement multiple: CLUSTALW"

Thread subject: error alignement multiple

[ Return to forums ]
error alignement multiple
Bonaiti
21 May 2012 16:14
Non evaluated contribution
Bonjour,

lorsque je rentre toutes mes séquences pour faire l'alignement multiple avec t-coffee, un message d'erreur apparait : Alignment input: sequences too long (in average). Et je ne vois pas bien ce que je peux faire pour y remedier. Qu'est ce que je dois faire?  

Merci
R_Bourgeas_12
21 May 2012 19:42
Game master
Bonsoir,

En fait, vous ne pouvez rien faire ; T-coffee est un programme d'alignement multiple très coûteux en temps de calcul, donc il n'accepte pas les séquences trop longues, ce qui est votre cas.
Je vous conseille donc d'utiliser les autres programmes d'alignements multiple.

Bonne soirée,

Raphaël
Bonaiti
21 May 2012 20:48
Non evaluated contribution
Bonsoir,

J'ai aussi essayé avec ClustalW et Muscle mais j'obtiens le même résultat. Je ne peux donc pas faire l'alignement multiple?

Merci. Bonne soirée