Forum "Analyse phylogénétique"

Thread subject: arbre

[ Return to forums ]
arbre
SoMe
7 Mar 2012 11:55
Non evaluated contribution
bonjour, j'ai fait un arbre du vivant pour determiner mon groupe d'étude et mon groupe externe car je ne pouvais pas le determiner avec le lineage report (les scores sont trop élevé). En suivant cet arbre je devais prendre les bacteries comme groupe d'études et les archae+eucaryote comme groupe externe. Seulement, Mme wirth m'a dit que je devais prendre les cyano+eucaryote en étude et toutes les autres bactéries en externe. Cependant en suivant ces groupes il m'est impossible de construire un arbre! j'ai supprimer les sequences qui avaient beaucoup de gap, mais le resultat est le même. Que dois je faire? Reprendre mes premiers groupes d'étude (qui fonctionnaient) ou persister avec ceux la alors que ça ne marche pas?